Tor Project, Inc，在2006年依據美國501(c)(3)創立的非牟利組織，然而「onion路由」的構想則是起源於1990年代中期。

就像 Tor 用戶一樣，使 Tor 成真的眾多開發人員、研究人員和創始人都是一群來自不同領域的人。而所有參與者都是因爲一個共同的信念而團結在一起：網路用戶應該有權在不受審查地連接網路世界。

在1990年代，網路安全相當匱乏，且追蹤與監視的活動日益活躍，在1995年時，美國海軍研究實驗室(NRL)的David Goldschlag、Mike Reed與Paul Syverson開始思考，能否有一種建立網路連接的方法，讓連線兩端的人對話時，網路監聽者也無從得知通話者的身份。 他們的答案，就是著手設計並佈署第一個onion路由的原型研究。

onion路由的目標，就是要發展出一種可以盡可能保有最多隱私的方式來使用網路，其概念是讓網路流量通過數台伺服器進行交換轉送，並在這個過程中的每個步驟執行加密。 這依然是對 Tor 今天的運作原理最簡單的解釋。

在2000年代初期，麻省理工學院(MIT) 的應屆畢業生Roger Dingledine 開始與 Paul Syverson 一起進行美國海軍研究實驗室 onion路由專案。 為了區分美國海軍研究實驗室的這項原創工作計畫與其他地區出現的onion路由專案，Roger 將他命名為Tor Project，即是「The Onion Routing」的縮寫。 Roger 麻省理工的同學 Nick Mathewson不久後也加入了這個專案團隊。

早從1990年代的概念構思階段開始，onion 路由的想法就是利用一個去中心化的中繼來轉送連線資料，這個網絡的組成必須是非常多元，由無數個完全獨立且擁有不同利益與信任關係的組織團體所聯合維運，並且該軟體也必須要免費且開源的，才能夠將透明化與去中心化精神作最大程度的發揮。 因此，Tor 網路在2002年十月開始初步佈署時，其原始程式碼就是以免費開放軟體授權發布。 截至2003年底，這個網絡已經擁有數十個由志願者所架設的節點，其中大多數在美國，另外一個在德國。

由於肯定 Tor 在數位人權上的重要性，從2004年開始電子前哨基金會(EFF)也開始贊助 Roger 與 Nick 的Tor 專案計畫。到了2006年時，Tor Project Inc. 正式依據美國501(c)(3)創立登記為非牟利組織，以持續開發 Tor 技術。

在2007年，該組織開始開發 Tor 網路的橋接器來回應網路審查的問題，例如需要繞過政府的防火牆，好使用戶得以存取公開網路。

Tor 開始在社運活動者和精通技術且對隱私感興趣的的用戶中漸漸流行起來，但對於非技術背景的人們來說仍然難以使用，因此從2005年開始，開始開發 Tor 代理伺服器之外的工具。 Tor 瀏覽器的開發始於2008.

因著 Tor 瀏覽器，令到Tor 對日常網絡用戶來說更輕易能夠存取，它也在2010年末的阿拉伯之春運動中成為了相當關鍵的工具。Tor 不只是保護了人們線上的身份，更讓他們可以存取那些被封鎖的關鍵資源、社交媒體和網站。

因著2013年Snowden事件揭發後，對全面抵抗網路監控審查的防禦工具的需求，成為社會大眾所關心的主流議題。 Tor 不僅對Snowden的吹哨事件有關鍵的幫助，同時文件的內容也支持了當時Tor 不能被破解的保證。

人們對追蹤，監視和審查制度的意識也許已經增強，但同時妨礙網路自由的情況，也普遍增加。 如今，這網絡擁有由志工運作的數千個中繼站以及全球數百萬的用戶，正是這樣的多樣性確保了 Tor 用戶的安全。

Tor Project 每天都在為了讓每一個人都能隱密的造訪不受審查過濾的網路而奮鬥，而 Tor 已成為世界上最強大的線上隱私和自由的工具。

但是 Tor 不僅僅是軟體工具，它也是一份充滿愛心的工作，由一群致力於人權的國際社群人們所共同打造。Tor Project 深深致力於 落實透明化精神與用戶安全。